南麂列岛位于浙江省平阳县东南海域，面积19600公顷，1989年经平阳县人民政府批准建立，1990年被批准为国家级，主要保护对象为海洋贝藻类及生态环境。本区地处台湾暖流与江浙沿岸流交汇和交替消涨的海区，属亚热带海洋季风气候。区内海洋生物物种繁多，区系成分复杂，自然生态系统保存良好。

　　自然保护区已鉴定的海洋贝类有403种，其中19种为国内首次记录，海洋底栖藻类有174种，其中黑叶马尾藻为世界海洋藻类的新种，贝藻类种数约占全国的29% 以上。本区的贝藻类不仅种类丰富，而且还具有温、热带两种区系特征和地域上的断裂分布现象，堪称我国近海贝藻类的一个重要基因库。